Di Cesare Andrea

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  • Largo Tonolli 50
    28922 Verbania (VB)

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  • +39 0323 518321 (Telephone)
  • +39 0323 556513 (Fax)
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Altre informazioni

Broad research specialisms:

  • Antibiotic resistance in the environment
  • Relationship between antibiotic resistant and virulent environmental and clinical strains
  • Horizontal Gene Transfer (HGT) in environmental strains

Qualifications:

2014: PhD Biomolecular Science, University of Ancona
2009: MSc Industrial Biotechnology, University of Urbino Career

Career:

2014-present: Postdoctoral fellow, CNR - Institute of Ecosystem Study, Verbania
2011-2014: PhD student Biomolecular Science, University of Ancona
2010: Research Fellow, IZSUM, Ancona

Research interests:

I work on the spread of antibiotic resistance at the molecular level in human gut, marine, and freshwater environments. My goal is to understand the role of antibiotic (AB) resistant strains/traits in natural bacterial communities, to evaluate HGT mechanisms, and to study the fitness cost AB-related accessories genes.

Research project:

Natural antibiotic resistances, and impact of AB on the resilience of the bacterial community


Publications:

  • Epidemic Escherichia coli ST131 and Enterococcus faecium ST17 in coastal marine sediments from an Italian beach Environmental Science and Technology 2013 Dec 3;47(23):13772-80. Vignaroli C, Luna GM, Pasquaroli S, Di Cesare A, Petruzzella R, Paroncini P, Biavasco F.
  • The marine environment as a reservoir of antibiotic-resistant and virulent enterococci strongly associated with clinical strains Environmental Microbiology Reports 2014 Apr 6;(2):184-90. Di Cesare A*, Pasquaroli S, Vignaroli C, Paroncini P, Luna GM, Manso E, Biavasco F.  
      * Corresponding Author
  • Aquaculture can promote the presence and spread of antibiotic-resistant enterococci in marine sediments PLoS One 2013 Apr 26;8(4):e62838. Di Cesare A*, Luna GM, Vignaroli C, Pasquaroli S, Tota S, Paroncini P, Biavasco F 
      * Corresponding Author
  • An extensive investigation into the prevalence and the genetic and serological diversity of toxigenic V. parahaemolyticus in Italian marine coastal waters Environmental Microbiology 2013 May;15(5):1377-1386. Ottaviani D, Leoni F, Rocchegiani E, Mioni R, Costa A, Virgilio S, Serracca L, Bove D, Canonico C, Di Cesare A, Masini L, Potenziani S, Caburlotto G, Ghidini V, Lleo MM.
  • Antibiotic-resistant enterococci in seawater and sediments from a coastal fish farm. Microbial Drug Resistance 2012 Oct;18(5):502-509 Di Cesare A, Vignaroli C, Luna GM, Pasquaroli S, Biavasco F.
  • New sequence types and multidrug resistance among pathogenic Escherichia coli isolates from coastal marine sediments. Applied Environmental Microbiology 2012 Jun;78(11):3916-3922 Vignaroli C, Luna GM, Rinaldi C, Di Cesare A, Danovaro R, Biavasco F.

Papers in preparation:

  • Erythromycin- and copper-resistant Enterococcus hirae from marine sediment and co-transfer of erm(B) and tcrB to Enterococcus faecalis Submitted Pasquaroli S, Di Cesare A, Vignaroli C, Conti G, Citterio B, Biavasco F.
  • Biofilm role in the protection of replicative form of Legionella pneumophila Submitted Andreozzi E, Di Cesare A, Sabatini L, Chessa E, Sisti D, Rocchi M, Citterio B.
  • Antibiotic resistance transfer and macrophage killing by an Enterococcus faecium isolate from coastal marine sediment Submitted Sabatino R **, Di Cesare A **, Pasquaroli S, Vignaroli C, Larossa D, Rossi L, Magnani M, Brenciani A, Biavasco F.

**Co-first Author *Corresponding Author


Pubblications


Journal articles

   2018
1Di Cesare A., Cabello-Yeves P. J., Chrismas N. A., Sánchez-Baracaldo P., Salcher M. M., Callieri C. Genome analysis of the freshwater planktonic Vulcanococcus limneticus sp. nov. reveals horizontal transfer of nitrogenase operon and alternative pathways of nitrogen utilization. In: Bmc Genomics, vol. 19 article n. 259. Crossmark, 2018.     
2Di Cesare A., Petrin S., Fontaneto D., Losasso C., Eckert E., Tassistro G., Borello A., Ricci A., Wilson W., Pruzzo C., Vezzulli L. ddPCR applied on archived Continuous Plankton Recorder samples reveals long-term occurrence of class 1 integrons and a sulphonamide resistance gene in marine plankton communities. In: Environmental Microbiology Reports, vol. 10 (4) pp. 458 - 464. Wiley, 2018.        
3Eckert E. M., Di Cesare A., Kettner M. T., Arias-Andres M., Fontaneto D., Grossart H., Corno G. Microplastics increase impact of treated wastewater on freshwater microbial community. In: Environmental Pollution, vol. 234 pp. 495 - 502. Elsevier, 2018.        
4Fiorentino A., Cucciniello R., Di Cesare A., Fontaneto D., Prete P., Rizzo L., Corno G., Proto A. Disinfection of urban wastewater by a new photo-Fenton like process using Cu-iminodisuccinic acid complex as catalyst at neutral pH. In: Water Research, vol. 146 pp. 206 - 215. Elsevier, 2018.        

   2017
5Callieri C., Amalfitano S., Corn G., Di Cesare A., Bertoni R., Eckert E. The microbiome associated with two Synechococcus ribotypes at different levels of ecological interaction. In: Journal of Phycology, vol. 53 pp. 1151 - 1158. Phycological Society of America, 2017.     
6Di Cesare A., Eckert E. M., Rogora M., Corno G. Rainfall increases the abundance of antibiotic resistance genes within a riverine microbial community. In: Environmental Pollution, vol. 226 pp. 473 - 478. Elsevier, 2017.     
7Di Sante L., Morroni G., Brenciani A., Vignaroli C., Antonelli A., D'Andrea M. M., Di Cesare A., Giovanetti E., Varaldo P. E., Rossolini G. M., Biavasco F. pHTβ-promoted mobilization of non-conjugative resistance plasmids from Enterococcus faecium to Enterococcus faecalis. In: Journal of Antimicrobial Chemotherapy, vol. 72 (9) pp. 2447 - 2453. Oxford Academy, 2017.     
8Turolla A., Sabatino R., Fontaneto D., Eckert E. M., Colinas N., Corno G., Citterio B., Biavasco F., Antonelli M., Mauro A., Mangiaterra G., Di Cesare A. Defence strategies and antibiotic resistance gene abundance in enterococci under stress by exposure to low doses of peracetic acid. In: Chemosphere, vol. 185 pp. 480 - 488. Elsevier, 2017.        

   2016
9Conficoni D., Losasso C., Cortini E., Di Cesare A., Cibin V., Giaccone V., Corno G., Ricci A. Resistance to biocides in listeria monocytogenes collected in meat-processing environments. In: Frontiers in Microbiology, vol. 7 article n. 1627. Frontiers Media, 2016.     
10Corno G., Di Cesare A., Eckert E. M. L'impegno del CNR: l'arretratezza italiana nella depurazione, rischio batteri. In: Villaggio Globale, vol. 75 pp. 36 - 37. Sorella Acqua. Villaggio Globale s.r.l, 2016.  
11Di Cesare A., Eckert E. M., D'Urso S., Bertoni R., Gillan D. C., Wattiez R., Corno G. Co-occurrence of integrase 1, antibiotic and heavy metal resistance genes in municipal wastewater treatment plants. In: Water Research, vol. 94 (1) pp. 208 - 2017. Elsevier, 2016.     
12Di Cesare A., Eckert E., Corno G. Co-selection of antibiotic and heavy metal resistance in freshwater bacteria. In: Journal of Limnology, vol. 75 (2s) pp. 59 - 66. PagePress, 2016.        
13Di Cesare A., Losasso C., Barco L., Eckert E. M., Conficoni D., Sarasini G., Corno G., Ricci A. Diverse distribution of Toxin-Antitoxin II systems in Salmonella enterica serovars. In: Scientific Reports, vol. 6 article n. 28759. Springer, 2016.     
14Di Cesare A., Fontaneto D., Doppelbauer J., Corno G. Fitness and recovery of bacterial communities and antibiotic resistance genes in urban wastewaters exposed to classical disinfection treatments. In: Environmental Science & Technology, vol. 50 (18) pp. 10153 - 10161. American Chemical Society, 2016.        
15Eckert E., Di Cesare A., Stenzel B., Fontaneto D., Corno G. Daphnia as a refuge for an antibiotic resistance gene in an experimental freshwater community. In: Science of the Total Environment, vol. 571 pp. 77 - 81. Elsevier, 2016.        
16Morroni G., Di Cesare A., Di Sante L., Brenciani A., Vignaroli C., Pasquaroli S., Giovanetti E., Sabatino R., Rossi L., Magnani M., Biavasco F. Enterococcus faecium ST17 from coastal marine sediment carrying transferable multidrug resistance plasmids. In: Microbial Drug Resistance-Mechanisms Epidemiology and Disease, vol. 22 (7) pp. 523 - 530. Mary Ann Liebert, Inc, 2016.     

   2015
17Casabianca A., Orlandi C., Barbieri F., Sabatini L., Di Cesare A., Sisti D., Pasquaroli S., Magnani M., Citterio B. Effect of starvation on survival and virulence expression of Aeromonas hydrophila from different sources. In: Archives of Microbiology, vol. 197 pp. 431 - 438. Springer, 2015.  
18Di Cesare A., Eckert E. M., Teruggi A., Fontaneto D., Bertoni R., Callieri C., Corno G. Constitutive presence of antibiotic resistance genes within the bacterial community of a large subalpine lake. In: Molecular Ecology, vol. 24 (15) pp. 3888 - 3900. Wiley, 2015.        
19Sabatino R., Di Cesare A., Pasquaroli S., Vignaroli C., Citterio B., Amiri M., Rossi L., Magnani M., Mauro A., Biavasco F. Adherence and intracellular survival within human macrophages of Enterococcus faecalis isolates from coastal marine sediment. In: Microbes and Infection, vol. 17 pp. 660 - 664. Elsevier, 2015.     
20Vignaroli C., Di Sante L., Magi G., Luna G. M., Di Cesare A., Pasquaroli S., Facinelli B., Biavasco F. Adhesion of marine cryptic Escherichia isolates to human intestinal epithelial cells. In: Isme Journal, vol. 9 (2) pp. 508 - 515. Nature publishing group, 2015.     

   2014
21Andreozzi E., Di Cesare A., Sabatini L., Chessa E., Sisti D., Rocchi M., Citterio B. Role of biofilm in protection of the replicative form of Legionella pneumophila. In: Current Microbiology, vol. 69 pp. 769 - 774. Springer, 2014.  

Proceedings

   2017
1Morabito G., Austoni M., Callieri C., Ciampittiello M., Corno G., Di Cesare A., Dresti C., Eckert E., Manca M., Piscia R., Rogora M., Saidi H., Bertoni R. Indagini limnologiche recenti sul Lago Maggiore: criticità emergenti, nuovi approcci di studio e possibili implicazioni gestionali. In: I grandi laghi profondi subalpini: dalla ricerca alla gestione (Verbania Pallanza, 25 ottobre 2016). Atti, pp. 1 - 7. CNR Edizioni, 2017.     

Technical reports

   2016
1Corno G., Di Cesare A., Eckert E. M., Contesini M., Bertoni R. Presenza e distribuzione di batteri antibiotico-resistenti nelle acque del Lago Maggiore. PROGRAMMA DI INDAGINI LIMNOLOGICHE SUL LAGO MAGGIORE. TRIENNIO 2013-2015. Responsabile: Dott. Giuseppe Morabito. Ente committente: Commissione Internazionale per la Protezione delle Acque Italo-Svizzere. Project report Campagna 2015 e rapporto triennale 2013-2015: 52-58, 2016.  
2Corno G., Di Cesare A., Eckert E. M., Contesini M., Bertoni R. Presenza e distribuzione di batteri antibiotico-resistenti nelle acque del Lago Maggiore: triennio 2013-2015. PROGRAMMA DI INDAGINI LIMNOLOGICHE SUL LAGO MAGGIORE. TRIENNIO 2013-2015. Responsabile: Dott. Giuseppe Morabito. Ente committente: Commissione Internazionale per la Protezione delle Acque Italo-Svizzere. Project report Campagna 2015 e rapporto triennale 2013-2015: 118-119, 2016.  

   2015
3Corno G., Di Cesare A., Eckert E. M., Contesini M., Bertoni R. Presenza e distribuzione di batteri antibiotico-resistenti nelle acque del Lago Maggiore. PROGRAMMA DI INDAGINI LIMNOLOGICHE SUL LAGO MAGGIORE. TRIENNIO 2013-2015. Responsabile: Dott. Giuseppe Morabito. Ente committente: Commissione Internazionale per la Protezione delle Acque Italo-Svizzere. Project report Campagna 2014: 51-58, 2015.  

   2014
4Corno G., Di Cesare A., Eckert E. M., Contesini M., Bertoni R. Presenza e distribuzione di batteri antibiotico-resistenti nelle acque del Lago Maggiore. PROGRAMMA DI INDAGINI LIMNOLOGICHE SUL LAGO MAGGIORE. TRIENNIO 2013-2015. Responsabile: Dott. Giuseppe Morabito. Ente committente: Commissione Internazionale per la Protezione delle Acque Italo-Svizzere. Project report Campagna 2013: 46-53, 2014.  

Abstracts

   2017
1Callieri C., Di Cesare A., Cabello Yeves P. J., Cristmas N., Salcher M., Sanchez-Baracaldo P. The genome of a freshwater planktonic Synechococcus strain reveals the potentiality to fix nitrogen. In: AIOL - XXIII Congresso della Associazione Italiana di Oceanologia e Limnologia "Funzionamento, alterazioni e recupero degli ecosistemi acquatici. Le scienze acquatiche per comprendere i cambiamenti e per renderne i cittadini consapevoli" (Cagliari, 26-29 settembre 2017).   
2Corno G., Di Cesare A., Eckert E., Yang Y., Subirats J. Modulate response of the microbiome and resistome of natural bacterial communities exposed to treated wastewater effluents. In: SAME17 - Symposium on Aquatic Microbial Ecology (Zagabria, Croazia, 3-8 settembre 2017).   
3Corno G., Eckert E. M., Di Cesare A., Fontaneto D., Yang Y. Wastewater effluents influence the microbiome and the resistome of the receiving water. In: FEMS 2017 - VII Congress of European Microbiologists (Valencia, Spagna, 9-13 luglio 2017).   
4Di Cesare A., Eckert E. M., Kettner M. T., Arias-Andrés M., Fontaneto D., Grossart H., Corno G. Microplastics increase int1 abundance and persistence of wastewater-derived microbes in freshwater. In: SIM 2017 - XLV Congresso Nazionale della Società Italiana di Microbiologia (Genova, 27-30 settembre 2017).   

   2016
5Callieri C., Amalfitano S., Corno G., Bertoni R., Eckert E., Di Cesare A., Chrismas N. A., Sánchez Baracaldo P. Microcolony formation in non-axenic Synechococcus cultures: do the associated bacteria matter?. In: SIL - XXXIII Congresso della Società Internazionale di Limnologia (Torino, 31 luglio - 5 agosto 2016). Abstract, pp. 249 - 249. International Society of Limnology, 2016.  
6Corno G., D'Urso S., Di Cesare A., Eckert E., Teruggi A. Resistance genes quantification for a direct and precise estimation of antibiotics pollution in freshwaters. In: XVI Giornata mondiale dell'acqua "Inquinamento antropico di acque e suoli in Italia" (Roma, Accademia Nazionale dei Lincei, 21 marzo 2016).   
7Corno G., Di Cesare A., Eckert E., Contesini M., Bertoni R., Callieri C. Spatial and temporal dynamics of antibiotic resistance genes in subalpine Lake Maggiore and in its catchment area. In: SIL - XXXIII Congresso della Società Internazionale di Limnologia (Torino, 31 luglio - 5 agosto 2016). Abstract, pp. 342 - 343. International Society of Limnology, 2016.  
8Di Cesare A., Eckert E., D'Urso S., Doppelbauer J., Corno G. Fate of antibiotic resistance genes within the microbial communities of three waste water treatment plants. In: SIL - XXXIII Congresso della Società Internazionale di Limnologia (Torino, 31 luglio - 5 agosto 2016). Abstract, pp. 106 - 106. International Society of Limnology, 2016.  
9Eckert E., Amalfitano S., Di Cesare A., Corno G., Fontaneto D. A lake's microbiome: from zooplankton to sediments. In: SIL - XXXIII Congresso della Società Internazionale di Limnologia (Torino, 31 luglio - 5 agosto 2016). Abstract, pp. 209 - 210. International Society of Limnology, 2016.  
10Sánchez-Baracaldo P., Chrismas N. A., Di Cesare A., Callieri C. Comparative genomics and phylogenetic analyses of non-marine picocyanobacteria. In: SIL - XXXIII Congresso della Società Internazionale di Limnologia (Torino, 31 luglio - 5 agosto 2016). Abstract, pp. 246 - 247. International Society of Limnology, 2016.  

   2015
11Corno G., Manfredini G., Eckert E., Di Cesare A., Quero G., Luna G. M. Antibiotics and pathogens, when the natural bacterial community resists!. In: AIOL - XXII Congresso dell'Associazione Italiana di Oceanologia e Limnologia "Le alterazioni del ciclo dell'acqua. Interazioni tra acque continentali e oceani in un pianeta in rapido cambiamento" (Verbania Pallanza, 28 settembre - 1 ottobre 2015). Abstract, pp. 24 - 24. AIOL, 2015.     
12Di Cesare A., Eckert E., Corno G. Constitutive presence of antibiotic resistance genes within the bacterial community of a large subalpine lake. In: FEMS 2015 - VI Congress of European Microbiologists (Maastricht, Olanda, 7-11 giugno 2015).   
13Di Cesare A., Eckert E., Fontaneto D., Pernthaler J., Villiger J., Teruggi A., Callieri C., Bertoni R., Corno G. Constitutive presence of antibiotic resistance genes within the bacterial community of a large subalpine lake. In: II EMBO Conference on Aquatic Microbial Ecology (Uppsala, Svezia, 23-28 agosto 2015).   
14Di Cesare A., Eckert E., Teruggi A., Fontaneto D., Bertoni R., Callieri C., Pernthaler J., Villiger J., Corno G. Lake water as reservoir of antibiotic resistance genes constitutively present within the natural microbial community. In: AIOL - XXII Congresso dell'Associazione Italiana di Oceanologia e Limnologia "Le alterazioni del ciclo dell'acqua. Interazioni tra acque continentali e oceani in un pianeta in rapido cambiamento" (Verbania Pallanza, 28 settembre - 1 ottobre 2015). Abstract, pp. 27 - 27. AIOL, 2015.     
15Eckert E., Di Cesare A., Stenzel B., Amalfitano S., Corno G., Fontaneto D. Zooplankton as refuge for invading bacteria. In: AIOL - XXII Congresso dell'Associazione Italiana di Oceanologia e Limnologia "Le alterazioni del ciclo dell'acqua. Interazioni tra acque continentali e oceani in un pianeta in rapido cambiamento" (Verbania Pallanza, 28 settembre - 1 ottobre 2015). Abstract, pp. 28 - 28. AIOL, 2015.     
16Eckert E., Di Cesare A., Stenzel B., Amalfitano S., Corno G., Fontaneto D. Zooplankton as vectors for bacterial epibionts. In: XIV International Rotifer Symposium (Ceske Budejovice, Repubblica Ceca, 30 agosto - 4 settembre 2015).   
17Eckert E., Di Cesare A., Stenzel B., Amalfitano S., Corno G., Fontaneto D. Zooplankton as vectors for bacterial epibionts. In: II EMBO Conference on Aquatic Microbial Ecology (Uppsala, Svezia, 23-28 agosto 2015).   
18Morabito G., Di Cesare A., Fontaneto D., Guerrieri N., Manca M., Riccardi N., Piscia R., Rogora M. Rebirth of a lake. The history of the liming intervention and future resaerch in Lake Orta, looking at the next 25 years. In: Living Waters. Acqua, laghi e cambiamenti climatici (Pettenasco (NO), 18 settembre 2015).